Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms