Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms