Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.3 ms