Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms