Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms