Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HAPLN4Q86UW8 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HAPLN4Q86UW8 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HAPLN4Q86UW8 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HAPLN4Q86UW8 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HAPLN4Q86UW8 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HAPLN4Q86UW8 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HAPLN4Q86UW8 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HAPLN4Q86UW8 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HAPLN4Q86UW8 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HAPLN4Q86UW8 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HAPLN4Q86UW8 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HAPLN4Q86UW8 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HAPLN4Q86UW8 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HAPLN4Q86UW8 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HAPLN4Q86UW8 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HAPLN4Q86UW8 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HAPLN4Q86UW8 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HAPLN4Q86UW8 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HAPLN4Q86UW8 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HAPLN4Q86UW8 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HAPLN4Q86UW8 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HAPLN4Q86UW8 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
HAPLN4Q86UW8 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HAPLN4Q86UW8 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HAPLN4Q86UW8 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
HAPLN4Q86UW8 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HAPLN4Q86UW8 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
HAPLN4Q86UW8 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
HAPLN4Q86UW8 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HAPLN4Q86UW8 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
HAPLN4Q86UW8 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HAPLN4Q86UW8 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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