Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0L9

Transmembrane protein LOC653160, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q7L0L9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q7L0L9 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q7L0L9 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q7L0L9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q7L0L9 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q7L0L9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q7L0L9 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q7L0L9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q7L0L9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q7L0L9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q7L0L9 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q7L0L9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q7L0L9 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q7L0L9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q7L0L9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q7L0L9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q7L0L9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q7L0L9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q7L0L9 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q7L0L9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q7L0L9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q7L0L9 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q7L0L9 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q7L0L9 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q7L0L9 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q7L0L9 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q7L0L9 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q7L0L9 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q7L0L9 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q7L0L9 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q7L0L9 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q7L0L9 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q7L0L9 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q7L0L9 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q7L0L9 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q7L0L9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q7L0L9 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q7L0L9 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q7L0L9 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q7L0L9 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q7L0L9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q7L0L9 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q7L0L9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q7L0L9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q7L0L9 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q7L0L9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q7L0L9 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q7L0L9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q7L0L9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q7L0L9 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q7L0L9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q7L0L9 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q7L0L9 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q7L0L9 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms