Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PPP4R4Q6NUP7 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms