Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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C9orf135Q5VTT2 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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C9orf135Q5VTT2 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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C9orf135Q5VTT2 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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C9orf135Q5VTT2 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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C9orf135Q5VTT2 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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C9orf135Q5VTT2 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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C9orf135Q5VTT2 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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C9orf135Q5VTT2 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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C9orf135Q5VTT2 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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