Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
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GEN1Q17RS7 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
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GEN1Q17RS7 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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GEN1Q17RS7 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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GEN1Q17RS7 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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GEN1Q17RS7 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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GEN1Q17RS7 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
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GEN1Q17RS7 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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GEN1Q17RS7 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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GEN1Q17RS7 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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