Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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