Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 Metazoa_SRP.91-201ENST00000622745 281 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
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E2F4Q16254 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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E2F4Q16254 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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E2F4Q16254 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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E2F4Q16254 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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