Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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