Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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