Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms