Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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