Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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TUBA3CQ13748 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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TUBA3CQ13748 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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TUBA3CQ13748 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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TUBA3CQ13748 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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TUBA3CQ13748 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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TUBA3CQ13748 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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TUBA3CQ13748 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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