Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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ATP1A4Q13733 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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