Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME3Q13232 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME3Q13232 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME3Q13232 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME3Q13232 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME3Q13232 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME3Q13232 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME3Q13232 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME3Q13232 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME3Q13232 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME3Q13232 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME3Q13232 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME3Q13232 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME3Q13232 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME3Q13232 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME3Q13232 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME3Q13232 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME3Q13232 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME3Q13232 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME3Q13232 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME3Q13232 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME3Q13232 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME3Q13232 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME3Q13232 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME3Q13232 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NME3Q13232 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NME3Q13232 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME3Q13232 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME3Q13232 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NME3Q13232 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME3Q13232 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME3Q13232 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME3Q13232 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME3Q13232 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME3Q13232 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME3Q13232 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME3Q13232 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms