Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms