Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms