Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGM3Q08188 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGM3Q08188 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TGM3Q08188 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGM3Q08188 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGM3Q08188 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TGM3Q08188 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGM3Q08188 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TGM3Q08188 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGM3Q08188 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGM3Q08188 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TGM3Q08188 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGM3Q08188 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGM3Q08188 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TGM3Q08188 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TGM3Q08188 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TGM3Q08188 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TGM3Q08188 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TGM3Q08188 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TGM3Q08188 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TGM3Q08188 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TGM3Q08188 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TGM3Q08188 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TGM3Q08188 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TGM3Q08188 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TGM3Q08188 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGM3Q08188 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TGM3Q08188 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TGM3Q08188 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGM3Q08188 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGM3Q08188 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TGM3Q08188 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TGM3Q08188 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGM3Q08188 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TGM3Q08188 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TGM3Q08188 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TGM3Q08188 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TGM3Q08188 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGM3Q08188 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGM3Q08188 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TGM3Q08188 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TGM3Q08188 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TGM3Q08188 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGM3Q08188 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TGM3Q08188 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms