Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP27A1Q02318 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP27A1Q02318 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP27A1Q02318 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP27A1Q02318 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP27A1Q02318 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP27A1Q02318 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP27A1Q02318 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP27A1Q02318 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP27A1Q02318 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP27A1Q02318 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP27A1Q02318 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP27A1Q02318 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP27A1Q02318 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP27A1Q02318 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYP27A1Q02318 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYP27A1Q02318 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYP27A1Q02318 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYP27A1Q02318 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYP27A1Q02318 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYP27A1Q02318 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYP27A1Q02318 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYP27A1Q02318 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYP27A1Q02318 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYP27A1Q02318 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYP27A1Q02318 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYP27A1Q02318 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYP27A1Q02318 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYP27A1Q02318 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYP27A1Q02318 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYP27A1Q02318 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYP27A1Q02318 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYP27A1Q02318 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms