Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms