Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NMUP48645 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NMUP48645 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NMUP48645 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NMUP48645 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NMUP48645 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NMUP48645 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NMUP48645 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NMUP48645 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NMUP48645 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NMUP48645 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NMUP48645 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NMUP48645 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NMUP48645 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NMUP48645 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NMUP48645 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NMUP48645 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NMUP48645 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NMUP48645 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NMUP48645 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NMUP48645 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NMUP48645 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NMUP48645 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NMUP48645 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NMUP48645 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NMUP48645 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NMUP48645 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NMUP48645 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NMUP48645 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NMUP48645 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NMUP48645 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NMUP48645 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NMUP48645 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NMUP48645 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
NMUP48645 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
NMUP48645 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
NMUP48645 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
NMUP48645 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
NMUP48645 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
NMUP48645 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms