Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.5 ms