Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms