Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KB1P23443 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms