Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
USF1P22415 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
USF1P22415 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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