Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRHP20396 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRHP20396 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRHP20396 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRHP20396 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRHP20396 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRHP20396 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRHP20396 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRHP20396 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRHP20396 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRHP20396 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRHP20396 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRHP20396 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRHP20396 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRHP20396 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRHP20396 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRHP20396 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRHP20396 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRHP20396 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRHP20396 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRHP20396 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRHP20396 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRHP20396 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRHP20396 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRHP20396 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRHP20396 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRHP20396 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRHP20396 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRHP20396 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRHP20396 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRHP20396 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRHP20396 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRHP20396 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRHP20396 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRHP20396 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRHP20396 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRHP20396 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRHP20396 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRHP20396 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRHP20396 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRHP20396 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRHP20396 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRHP20396 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRHP20396 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRHP20396 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRHP20396 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRHP20396 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRHP20396 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRHP20396 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRHP20396 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRHP20396 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRHP20396 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRHP20396 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRHP20396 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRHP20396 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRHP20396 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRHP20396 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRHP20396 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRHP20396 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRHP20396 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRHP20396 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRHP20396 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRHP20396 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRHP20396 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRHP20396 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRHP20396 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRHP20396 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRHP20396 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRHP20396 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRHP20396 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRHP20396 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRHP20396 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRHP20396 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRHP20396 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRHP20396 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRHP20396 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRHP20396 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRHP20396 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRHP20396 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRHP20396 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRHP20396 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRHP20396 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRHP20396 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRHP20396 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRHP20396 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRHP20396 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRHP20396 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRHP20396 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRHP20396 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRHP20396 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRHP20396 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRHP20396 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRHP20396 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRHP20396 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRHP20396 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRHP20396 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRHP20396 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRHP20396 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRHP20396 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRHP20396 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms