Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms