Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms