Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms