Protein–RNA interactions for Protein: O95389

WISP3, WNT1-inducible-signaling pathway protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WISP3O95389 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WISP3O95389 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WISP3O95389 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WISP3O95389 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WISP3O95389 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WISP3O95389 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WISP3O95389 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WISP3O95389 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WISP3O95389 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WISP3O95389 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WISP3O95389 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WISP3O95389 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
WISP3O95389 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WISP3O95389 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WISP3O95389 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WISP3O95389 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
WISP3O95389 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WISP3O95389 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WISP3O95389 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WISP3O95389 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WISP3O95389 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WISP3O95389 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WISP3O95389 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WISP3O95389 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WISP3O95389 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WISP3O95389 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WISP3O95389 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WISP3O95389 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WISP3O95389 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WISP3O95389 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WISP3O95389 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WISP3O95389 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WISP3O95389 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WISP3O95389 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WISP3O95389 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WISP3O95389 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WISP3O95389 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WISP3O95389 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WISP3O95389 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WISP3O95389 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
WISP3O95389 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WISP3O95389 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WISP3O95389 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WISP3O95389 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WISP3O95389 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WISP3O95389 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WISP3O95389 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WISP3O95389 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WISP3O95389 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WISP3O95389 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WISP3O95389 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WISP3O95389 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms