Protein–RNA interactions for Protein: O60941

DTNB, Dystrobrevin beta, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTNBO60941 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTNBO60941 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTNBO60941 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTNBO60941 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTNBO60941 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTNBO60941 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTNBO60941 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTNBO60941 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTNBO60941 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTNBO60941 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTNBO60941 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTNBO60941 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTNBO60941 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTNBO60941 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTNBO60941 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTNBO60941 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DTNBO60941 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DTNBO60941 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DTNBO60941 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DTNBO60941 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTNBO60941 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTNBO60941 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTNBO60941 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTNBO60941 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTNBO60941 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTNBO60941 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTNBO60941 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTNBO60941 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTNBO60941 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTNBO60941 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTNBO60941 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTNBO60941 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTNBO60941 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTNBO60941 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTNBO60941 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTNBO60941 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTNBO60941 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTNBO60941 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTNBO60941 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTNBO60941 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTNBO60941 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTNBO60941 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTNBO60941 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTNBO60941 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTNBO60941 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTNBO60941 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTNBO60941 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTNBO60941 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DTNBO60941 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTNBO60941 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTNBO60941 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTNBO60941 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTNBO60941 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTNBO60941 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTNBO60941 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTNBO60941 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTNBO60941 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTNBO60941 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTNBO60941 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTNBO60941 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTNBO60941 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTNBO60941 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTNBO60941 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTNBO60941 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTNBO60941 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTNBO60941 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTNBO60941 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTNBO60941 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTNBO60941 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTNBO60941 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTNBO60941 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTNBO60941 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTNBO60941 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTNBO60941 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTNBO60941 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTNBO60941 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTNBO60941 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTNBO60941 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTNBO60941 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTNBO60941 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTNBO60941 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTNBO60941 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTNBO60941 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DTNBO60941 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTNBO60941 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTNBO60941 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTNBO60941 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTNBO60941 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTNBO60941 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTNBO60941 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTNBO60941 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTNBO60941 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTNBO60941 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTNBO60941 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTNBO60941 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTNBO60941 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTNBO60941 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTNBO60941 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTNBO60941 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTNBO60941 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms