Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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PDE6DO43924 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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PDE6DO43924 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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PDE6DO43924 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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PDE6DO43924 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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PDE6DO43924 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
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PDE6DO43924 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDE6DO43924 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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