Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNJ1O43426 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms