Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 AC109466.1-203ENST00000524297 1083 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 AC068987.2-201ENST00000565518 896 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 C1QTNF9B-203ENST00000382145 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 ANAPC10-202ENST00000451299 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 AC022395.1-201ENST00000451610 895 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP3K13O43283 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms