Protein–RNA interactions for Protein: H3BU77

CCDC179, Coiled-coil domain-containing protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC179H3BU77 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 RPL27A-201ENST00000314138 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 PTPN1-201ENST00000371621 4008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 TGFBI-201ENST00000442011 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 AQP2-201ENST00000199280 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 IL17REL-201ENST00000341280 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 SARDH-207ENST00000439388 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 WFS1-202ENST00000503569 3255 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 GRPEL2-201ENST00000329271 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 GRM7-201ENST00000357716 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 FAM102A-203ENST00000373095 4144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 MAP7-208ENST00000617204 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 SLC8A3-207ENST00000528359 2840 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 SLC8A3-210ENST00000534137 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 ITPRIP-203ENST00000358187 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 IKBKE-203ENST00000581977 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 AVIL-201ENST00000257861 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 OR4K13-203ENST00000641904 5684 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 PCSK1-202ENST00000508626 2234 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 CEACAM20-203ENST00000614924 1809 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 SF1-204ENST00000377390 3470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 SEPT9-204ENST00000427180 3635 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 TEX35-203ENST00000367641 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 PRKCQ-201ENST00000263125 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 USP30-201ENST00000257548 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 SHROOM3-201ENST00000296043 11020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 STAC2-201ENST00000333461 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 ZHX1-206ENST00000522655 3357 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 THSD1-201ENST00000258613 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 DNAJA4-201ENST00000343789 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 STAT3-202ENST00000389272 2615 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 AC093525.7-201ENST00000569852 3626 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 TK2-206ENST00000527800 2687 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 LINC01588-203ENST00000529902 4279 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 LDLR-203ENST00000535915 2768 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CCDC179H3BU77 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
CCDC179H3BU77 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CCDC179H3BU77 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
CCDC179H3BU77 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
CCDC179H3BU77 CSPG4P13-202ENST00000567704 4801 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
CCDC179H3BU77 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CCDC179H3BU77 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CCDC179H3BU77 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms