Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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C9orf172C9J069 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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C9orf172C9J069 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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C9orf172C9J069 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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C9orf172C9J069 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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C9orf172C9J069 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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