Protein–RNA interactions for Protein: A6NIR3

AGAP5, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP5A6NIR3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
AGAP5A6NIR3 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
AGAP5A6NIR3 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
AGAP5A6NIR3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AGAP5A6NIR3 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AGAP5A6NIR3 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
AGAP5A6NIR3 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AGAP5A6NIR3 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AGAP5A6NIR3 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
AGAP5A6NIR3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
AGAP5A6NIR3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP5A6NIR3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms