Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms