Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G9

DYNC1LI1, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI1Q9Y6G9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DYNC1LI1Q9Y6G9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DYNC1LI1Q9Y6G9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DYNC1LI1Q9Y6G9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DYNC1LI1Q9Y6G9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DYNC1LI1Q9Y6G9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DYNC1LI1Q9Y6G9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DYNC1LI1Q9Y6G9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DYNC1LI1Q9Y6G9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DYNC1LI1Q9Y6G9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DYNC1LI1Q9Y6G9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DYNC1LI1Q9Y6G9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms