Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRPRBQ9Y5M8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRPRBQ9Y5M8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRPRBQ9Y5M8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRPRBQ9Y5M8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRPRBQ9Y5M8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SRPRBQ9Y5M8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRPRBQ9Y5M8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRPRBQ9Y5M8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRPRBQ9Y5M8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRPRBQ9Y5M8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRPRBQ9Y5M8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRPRBQ9Y5M8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRPRBQ9Y5M8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRPRBQ9Y5M8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRPRBQ9Y5M8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRPRBQ9Y5M8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRPRBQ9Y5M8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SRPRBQ9Y5M8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRPRBQ9Y5M8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRPRBQ9Y5M8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRPRBQ9Y5M8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRPRBQ9Y5M8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRPRBQ9Y5M8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SRPRBQ9Y5M8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRPRBQ9Y5M8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRPRBQ9Y5M8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRPRBQ9Y5M8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRPRBQ9Y5M8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRPRBQ9Y5M8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRPRBQ9Y5M8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRPRBQ9Y5M8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRPRBQ9Y5M8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRPRBQ9Y5M8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SRPRBQ9Y5M8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRPRBQ9Y5M8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRPRBQ9Y5M8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRPRBQ9Y5M8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRPRBQ9Y5M8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRPRBQ9Y5M8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SRPRBQ9Y5M8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SRPRBQ9Y5M8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SRPRBQ9Y5M8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SRPRBQ9Y5M8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRPRBQ9Y5M8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRPRBQ9Y5M8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRPRBQ9Y5M8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRPRBQ9Y5M8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SRPRBQ9Y5M8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SRPRBQ9Y5M8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SRPRBQ9Y5M8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRPRBQ9Y5M8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRPRBQ9Y5M8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRPRBQ9Y5M8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRPRBQ9Y5M8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRPRBQ9Y5M8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRPRBQ9Y5M8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRPRBQ9Y5M8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SRPRBQ9Y5M8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRPRBQ9Y5M8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRPRBQ9Y5M8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SRPRBQ9Y5M8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SRPRBQ9Y5M8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SRPRBQ9Y5M8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SRPRBQ9Y5M8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SRPRBQ9Y5M8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SRPRBQ9Y5M8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SRPRBQ9Y5M8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SRPRBQ9Y5M8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SRPRBQ9Y5M8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SRPRBQ9Y5M8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SRPRBQ9Y5M8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SRPRBQ9Y5M8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SRPRBQ9Y5M8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SRPRBQ9Y5M8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SRPRBQ9Y5M8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SRPRBQ9Y5M8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SRPRBQ9Y5M8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SRPRBQ9Y5M8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SRPRBQ9Y5M8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SRPRBQ9Y5M8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SRPRBQ9Y5M8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SRPRBQ9Y5M8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SRPRBQ9Y5M8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SRPRBQ9Y5M8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SRPRBQ9Y5M8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SRPRBQ9Y5M8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SRPRBQ9Y5M8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SRPRBQ9Y5M8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SRPRBQ9Y5M8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SRPRBQ9Y5M8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SRPRBQ9Y5M8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SRPRBQ9Y5M8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SRPRBQ9Y5M8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SRPRBQ9Y5M8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SRPRBQ9Y5M8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SRPRBQ9Y5M8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SRPRBQ9Y5M8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SRPRBQ9Y5M8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SRPRBQ9Y5M8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms