Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
AFG3L2Q9Y4W6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AFG3L2Q9Y4W6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
AFG3L2Q9Y4W6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AFG3L2Q9Y4W6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
AFG3L2Q9Y4W6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
AFG3L2Q9Y4W6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AFG3L2Q9Y4W6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
AFG3L2Q9Y4W6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AFG3L2Q9Y4W6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AFG3L2Q9Y4W6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
AFG3L2Q9Y4W6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
AFG3L2Q9Y4W6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AFG3L2Q9Y4W6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
AFG3L2Q9Y4W6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
AFG3L2Q9Y4W6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
AFG3L2Q9Y4W6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
AFG3L2Q9Y4W6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
AFG3L2Q9Y4W6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
AFG3L2Q9Y4W6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AFG3L2Q9Y4W6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AFG3L2Q9Y4W6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
AFG3L2Q9Y4W6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
AFG3L2Q9Y4W6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
AFG3L2Q9Y4W6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
AFG3L2Q9Y4W6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
AFG3L2Q9Y4W6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AFG3L2Q9Y4W6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
AFG3L2Q9Y4W6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AFG3L2Q9Y4W6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AFG3L2Q9Y4W6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AFG3L2Q9Y4W6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AFG3L2Q9Y4W6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AFG3L2Q9Y4W6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AFG3L2Q9Y4W6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
AFG3L2Q9Y4W6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AFG3L2Q9Y4W6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
AFG3L2Q9Y4W6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
AFG3L2Q9Y4W6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
AFG3L2Q9Y4W6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AFG3L2Q9Y4W6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
AFG3L2Q9Y4W6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
AFG3L2Q9Y4W6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
AFG3L2Q9Y4W6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
AFG3L2Q9Y4W6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
AFG3L2Q9Y4W6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
AFG3L2Q9Y4W6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
AFG3L2Q9Y4W6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
AFG3L2Q9Y4W6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AFG3L2Q9Y4W6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
AFG3L2Q9Y4W6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AFG3L2Q9Y4W6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AFG3L2Q9Y4W6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AFG3L2Q9Y4W6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AFG3L2Q9Y4W6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
AFG3L2Q9Y4W6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AFG3L2Q9Y4W6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AFG3L2Q9Y4W6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
AFG3L2Q9Y4W6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AFG3L2Q9Y4W6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
AFG3L2Q9Y4W6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
AFG3L2Q9Y4W6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
AFG3L2Q9Y4W6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
AFG3L2Q9Y4W6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AFG3L2Q9Y4W6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
AFG3L2Q9Y4W6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
AFG3L2Q9Y4W6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
AFG3L2Q9Y4W6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AFG3L2Q9Y4W6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
AFG3L2Q9Y4W6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
AFG3L2Q9Y4W6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AFG3L2Q9Y4W6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
AFG3L2Q9Y4W6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
AFG3L2Q9Y4W6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AFG3L2Q9Y4W6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AFG3L2Q9Y4W6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
AFG3L2Q9Y4W6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AFG3L2Q9Y4W6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
AFG3L2Q9Y4W6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
AFG3L2Q9Y4W6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
AFG3L2Q9Y4W6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AFG3L2Q9Y4W6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
AFG3L2Q9Y4W6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AFG3L2Q9Y4W6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AFG3L2Q9Y4W6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AFG3L2Q9Y4W6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
AFG3L2Q9Y4W6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
AFG3L2Q9Y4W6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AFG3L2Q9Y4W6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
AFG3L2Q9Y4W6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AFG3L2Q9Y4W6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AFG3L2Q9Y4W6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AFG3L2Q9Y4W6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
AFG3L2Q9Y4W6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
AFG3L2Q9Y4W6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms