Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4BQ9Y4P1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4BQ9Y4P1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4BQ9Y4P1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4BQ9Y4P1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4BQ9Y4P1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4BQ9Y4P1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4BQ9Y4P1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4BQ9Y4P1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4BQ9Y4P1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4BQ9Y4P1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4BQ9Y4P1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4BQ9Y4P1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4BQ9Y4P1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4BQ9Y4P1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4BQ9Y4P1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4BQ9Y4P1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4BQ9Y4P1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4BQ9Y4P1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4BQ9Y4P1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4BQ9Y4P1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4BQ9Y4P1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4BQ9Y4P1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG4BQ9Y4P1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG4BQ9Y4P1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG4BQ9Y4P1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG4BQ9Y4P1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG4BQ9Y4P1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG4BQ9Y4P1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG4BQ9Y4P1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4BQ9Y4P1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4BQ9Y4P1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4BQ9Y4P1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4BQ9Y4P1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4BQ9Y4P1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4BQ9Y4P1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4BQ9Y4P1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG4BQ9Y4P1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG4BQ9Y4P1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG4BQ9Y4P1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG4BQ9Y4P1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG4BQ9Y4P1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATG4BQ9Y4P1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATG4BQ9Y4P1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG4BQ9Y4P1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG4BQ9Y4P1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG4BQ9Y4P1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms