Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX24Q9Y343 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX24Q9Y343 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX24Q9Y343 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms