Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X8

UBE2D4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D4, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D4Q9Y2X8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
UBE2D4Q9Y2X8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms