Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2J2

EPB41L3, Band 4.1-like protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L3Q9Y2J2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPB41L3Q9Y2J2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EPB41L3Q9Y2J2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms