Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y297

BTRC, F-box/WD repeat-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BTRCQ9Y297 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms